regPipe

 


> Step 1: masking skullbase
Time: Sat Aug 27 07:17:47 2011

   1. Read Image

   2. Change Labels
       - labellist_0 :
       - labellist_1 :
       - inputimage : Read Image from Postsurgery segmentation

   3. Read Image

   4. Operation filter
       - image1 : Image after changing labels
       - image2 : Read Image from Postsurgery image
       - image1constant : 0
       - image2constant : 0
       - constant1 : 0
       - constant2 : 0
       - multiply : 1
       - substract : 0
       - or : 0
       - add : 0

   5. Save Image
       - suffix : -mask
       - addtostack : 1
       - newstack : 4
       - inputimage : Image after operation
       - format : 0

> Step 2: Reg Seg Post to Preop
Time: Sat Aug 27 07:17:51 2011

   1. RView - Affine registration
       - classic : 1
       - sourceastarget : 0
       - sourceassource : 0
       - interpolation : 2
       - compute : 1
       - apply : 0
       - anotherdof : 0
       - usedofin : 0
       - source : 4
       - target : 1
       - dofstack : 5
       - outputstack : 5
       - anotherdofstack : 1
       - transform : 0
       - dofin : 1
       - dofsuffix : -reg.dof
       - imagesuffix : -reg

   2. RView - Affine registration
       - classic : 1
       - sourceastarget : 0
       - sourceassource : 0
       - interpolation : 0
       - compute : 0
       - apply : 1
       - anotherdof : 1
       - usedofin : 0
       - source : 2
       - target : 1
       - dofstack : 1
       - outputstack : 7
       - anotherdofstack : 5
       - transform : 0
       - dofin : 1
       - dofsuffix : -reg.dof
       - imagesuffix : -reg

   3. RView - Affine registration
       - classic : 1
       - sourceastarget : 0
       - sourceassource : 0
       - interpolation : 0
       - compute : 0
       - apply : 1
       - anotherdof : 1
       - usedofin : 0
       - source : 3
       - target : 1
       - dofstack : 1
       - outputstack : 6
       - anotherdofstack : 5
       - transform : 0
       - dofin : 1
       - dofsuffix : -reg.dof
       - imagesuffix : -reg

> Step 3: relabel all to 1 postsurgery
Time: Sat Aug 27 07:30:06 2011

   1. Read Image

   2. Change Labels
       - labellist_0 :
       - labellist_1 :
       - inputimage : Read Image from Presurgery segmentation

   3. Save Image
       - suffix : -red
       - addtostack : 1
       - newstack : 10
       - inputimage : Image after changing labels
       - format : 0

> Step 4: relabel all to 1 presurgery
Time: Sat Aug 27 07:30:09 2011

   1. Read Image

   2. Change Labels
       - labellist_0 :
       - labellist_1 :
       - inputimage : Read Image from Presurgery segmentation

   3. Save Image
       - suffix : -red
       - addtostack : 1
       - newstack : 10
       - inputimage : Image after changing labels
       - format : 0

> Step 5: Pipeline successfully finished !
Time: Sat Aug 27 07:30:13 2011