Difference between revisions of "Events:Slicer-Hands-On-Tokyo-2010"
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* 9:10 am - 9:30 am [[Media:Slicer3 Introduction IBMISPS2009 SoniaPujol.pdf | Slicer3 Overview and Applications ]](波多伸彦) | * 9:10 am - 9:30 am [[Media:Slicer3 Introduction IBMISPS2009 SoniaPujol.pdf | Slicer3 Overview and Applications ]](波多伸彦) | ||
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# Creating a 3D model of the tumour volume | # Creating a 3D model of the tumour volume | ||
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* 12:00 -1pm ランチョンセミナー （一般公開） | * 12:00 -1pm ランチョンセミナー （一般公開） | ||
*1:00 - 2:00 pm 特別講演Ron Kikinis （一般公開） | *1:00 - 2:00 pm 特別講演Ron Kikinis （一般公開） | ||
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Revision as of 16:41, 17 February 2010
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Contents
コースの目的
このコースは、オープンソースソフトウェアSlicerを活用して画像誘導手術シミュレーション、ナビゲーション、医用画像処理について体験講義を行うことを目的としています。通常の講義とはことなり、実際に自分のパソコンにソフトウェアをダウンロードして、臨床で用いられている画像データを使いながら、直接「手」で先端研究を感じてもらうことがコースの目的です。コースで使用するソフトウェアは無償でオープンソースが公開されており、コース終了後はこのソフトウェアを中心に研究を展開することができます。この展開方法についてもコース内で触れます。ハンズオンセミナーの質をあげるため、受講者に対する講師陣の人数を限りなく多くするようにとりはからっています。参加者はコースすべてに参加する必要があり、中途退室はみとめられていません。
講師
- 波多伸彦
Surgical Planning Laboratory, Brigham and Women's Hospital, Boston MA
- 徳田淳一
Surgical Planning Laboratory, Brigham and Women's Hospital, Boston MA
- 鈴木孝司（東京女子医科大学）
- 山田 篤史（名古屋工業大学）
- 林 雄一郎（名古屋大学）
- 鎮西清行（産業総合研究所）
- 洪在成（九州大学）
日時
- 日時：２０１０年３月１６日（火曜日）
- Time: 9am - 4pm
- Location: 東京女子医大
- 参加者は各自のノートブックパソコンにSlicerをダウンロードしてコンパイルできる方に限ります。医師、研修医、技師、理工学大学院生を対象としてカリキュラムは組まれています。
- ハンズオンの講義のため、参加者の人数を限定しています。お早めに登録ください。
参加登録
- 参加希望者はhata@bwh.harvard.eduまで名前、所属、使用パソコンのOSをお送りください。
参加登録者リスト
講義シラバス
午前：Slicerの基礎
- 9:00 am - 9:10 am インストール確認、サポート
- 9:10 am - 9:30 am Slicer3 Overview and Applications (波多伸彦)
- 9:30 am - 10:30 am Hands-on Session 1: Data Loading and 3D Visualization （日本語版スライド準備中）(鈴木孝司、問い合わせ中)
- 10:30 am - 10:45 am Coffee-break
- 10:45 am - 11:30 am Neurosurgical Planning and Guidance by Slicer（日本語版スライド準備中）(山田 篤史、林 雄一郎)
- Module 1-3 (1:30-2:45 pm)
- Loading and visualizing anatomical MRI data
- Incorporating fMRI data using image registration and thresholding
- Creating a 3D model of the tumour volume
- 11:30 am - 12:00 pm 質疑応答
一般公開：特別講演
- 12:00 -1pm ランチョンセミナー （一般公開）
- 1:00 - 2:00 pm 特別講演Ron Kikinis （一般公開）
午後：画像誘導手術
- 2:00 - 2:15 pm Introduction: Why Slicer3 for your IGT research? An overview of Slicer3 for IGT. (15 min. 鎮西清行)
- 2:30 - 3:30 pm
- Module 4-6 Neurosurgical Planning and Guidance by Slicer（日本語版スライド準備中）(洪在成)
- Predicting the locations of brain structures using image registration and a brain atlas
- Incorporating brain fiber tractography from diffusion weighted images
- Annotating the preoperative plan and saving the scene
- 3:30 - 4:45 pm Coffee-break
- Slicerを用いた研究モジュールの作り方(徳田淳一）
- Slicerによる産学連携（Aze)
参加準備
Please complete the following items prior to the course. Support will be provided as requested
- Software Installation: Please install the newest Slicer3.4 release appropriate to the computer you will be bringing to the workshop:
- Windows: Slicer3-3.4-2009-05-21-win32.exe
- Mac OSX Darwin PPC: Slicer3-3.4.2009-05-21-darwin-ppc.tar.gz
- Mac OSX Darwin Intel: Slicer3-3.4.2009-05-21-darwin-x86.tar.gz
- Linux x86: Slicer3-3.4.2009-05-21-linux-x86.tar.gz
- Linux x86-64: Slicer3-3.4.2009-05-21-linux-x86_64.tar.gz
The instructions for installing the Slicer3 program describe the different steps of the procedure on Mac OS, Linux and Windows.
Recommended configuration: Windows XP, Linux (x86 or x86_64), Mac OS (ppc or Intel), 2 GB of RAM and a dedicated graphic accelerator with 128 MB of on board graphic memory.
- Data to download: Please install the Slicer3VisualizationDataset.
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