Difference between revisions of "Tokyo 2013 Training"

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*ハーバード大学医学部  助教　Sonia Pujol, PhD
 
*ハーバード大学医学部  助教　Sonia Pujol, PhD
  
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*9:00-9:10 開会挨拶  
 
*9:00-9:10 開会挨拶  
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*9:10-9:30 Presentation of  [http://www.na-mic.org NA-MIC] ([http://www.spl.harvard.edu/~kikinis Ron Kikinis])
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*9:10-10:00  Hands-on session 1: [[media:DataLoadingAndVisualizationSlicer4_Madrid2012_SoniaPujol.pdf | Introduction to 3DSlicer basics: Data loading and 3D visualization]] (Sonia Pujol)
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*9:30-10:00  Hands-on session 1:[[media:DataLoadingAndVisualizationSlicer4_Madrid2012_SoniaPujol.pdf | Introduction to 3DSlicer basics: Data loading and 3D visualization]]  
 
 
*10:00-10:45 Hands-on session 2:[http://www.slicer.org/slicerWiki/images/f/f1/NeurosurgicalPlanning_SoniaPujol.pdf Use case clinical scenario: white matter exploration for neurosurgical planning ] (Sonia Pujol)
 
*10:00-10:45 Hands-on session 2:[http://www.slicer.org/slicerWiki/images/f/f1/NeurosurgicalPlanning_SoniaPujol.pdf Use case clinical scenario: white matter exploration for neurosurgical planning ] (Sonia Pujol)
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*10:45-11:00 Coffee-Break
 
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*11:00-12:00 Hands-on session 3: [[media:3DVisualizationDICOM_RadiologyApplications_SoniaPujol_JRC2013.pdf | Connecting Slicer to PACS system ]] (Nicholas Herlambang)
 
  
 
==昼食==
 
==昼食==
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*12:00-13:00 昼食（会場付近にて参加者各人で外食）
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*11:30-12:30 昼食（会場付近にて参加者各人で外食）
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*13:00-13:30 AZE商品紹介
 
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==特別講演==
 
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*13:30-14:00 Talk on [http://www.slicer.org 3D Slicer] ([http://www.spl.harvard.edu/~kikinis Ron Kikinis])
 
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*14:00-14:30 Time series image analysis on Dynamic Contrast MRI of prostate (Karl Diedrich)
 
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*14:30-14:45 Coffee-Break
 
  
 
==午後の部==
 
==午後の部==
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*14:45-16:00 Hands-on Session 4: [http://wiki.slicer.org/slicerWiki/images/e/ed/OpenIGTLinkTutorial_Slicer4.1.0_JunichiTokuda_Oct2012.pdf Using Slicer for Image Guided Therapy and Robotics] (Nobuhiko Hata)
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*12:30-13:00 AZE商品紹介
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*16:00-16:10 Slicer resources and community (Sonia Pujol)
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*13:00-13:45 Hands-on session 3: [[media:3DVisualizationDICOM_RadiologyApplications_SoniaPujol_JRC2013.pdf | Connecting Slicer to PACS system ]] (Nicholas Herlambang)
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*16:10-16:30 Concluding remarks and discussion
 
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*17:00-18:00 Reception for Instructors
 
  
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== Registration for the workshop ==
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*13:45-14:15 Presentation of  [http://www.na-mic.org NA-MIC] ([http://www.spl.harvard.edu/~kikinis Ron Kikinis])
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*14:15-14:30 Talk on [http://www.slicer.org 3D Slicer] ([http://www.spl.harvard.edu/~kikinis Ron Kikinis])
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*14:30-14:45 Break
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*14:45-15:30 Hands-on session 4: [[media:MultiVolumeExplorer_Meysam_SNR-April2013-v3.pdf|Time series image analysis on Dynamic Contrast MRI of prostate]] (Karl Diedrich)
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*15:30-16:15 Hands-on Session 5: [http://wiki.slicer.org/slicerWiki/images/e/ed/OpenIGTLinkTutorial_Slicer4.1.0_JunichiTokuda_Oct2012.pdf Using Slicer for Image Guided Therapy and Robotics (OpenIGTLink)] (Nobuhiko Hata)
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*16:15-16:30 Closing
  
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*参加費は無料です。下記の情報を、受け付け窓口のまでお送りください。
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=参加申込 =
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**氏名
 
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**ご所属
 
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**役職
 
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**当日お持ちのパソコンのOS、メモリ容量
 
  
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=参加申込 =
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*申し訳ありませんが、定員に達したため登録を閉め切りました。９月のMICCAI（名古屋）開催時に時期を合わせて次回のワークションプを開催する予定です。
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*参加費無料
 
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*参加希望者はNicholas Herlambang（AZE　ボストンR&Dセンタ、nicholas.herlambang@azeresearch.com）まで名前、所属、使用パソコン（OS、メモリ容量）をお送りください。日本語のメールで結構です。
 
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*締切り：3/29(金)
 
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*定員：30名程度
 
  
 
== Preparation for the Workshop ==
 
== Preparation for the Workshop ==
 
The workshop combines oral presentations and instructor-led hands-on sessions with the participants working on their own laptop computers. A technical training staff will be providing one-to-one assistance as needed.
 
The workshop combines oral presentations and instructor-led hands-on sessions with the participants working on their own laptop computers. A technical training staff will be providing one-to-one assistance as needed.
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All participants are required to come with their own computer and install the Slicer4.1software and data. Windows, Linux or MacOS Lion are supported. A minimum of 4GB of RAM (8 or more are recommended)and a dedicated graphic accelerator with 1GB of on board graphic memory are required.'''
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All participants are required to come with their own computer and install the 3D Slicer software and data. Windows, Linux or MacOS Lion are supported. A minimum of 4GB of RAM (8 or more are recommended)and a dedicated graphic accelerator with 1GB of on board graphic memory are required.
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*'''Software"'':
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** MacOSX  [http://download.slicer.org/bitstream/40004 Slicer_nightly-build_2013-03-28 MacOSX]
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Please download the following software and datasets.
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** Linux 64 [http://download.slicer.org/bitstream/40003 Slicer_nightly-build_2013-03-28 Linux64]
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** Windows 7 64 [http://slicer.kitware.com/midas3/download?items=19141 Slicer_nightly-build_2013-03-28 Win64]
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* '''Software''':
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** Windows 7 32 [http://slicer.kitware.com/midas3/download?items=19153 Slicer_nightly-build_2013-03-28 Win32]
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** MacOSX  [http://slicer.kitware.com/midas3/download?items=19691 Slicer_nightly-build_2013-04-04 MacOSX]
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** Linux 64 [http://download.slicer.org/bitstream/41878 Slicer_nightly-build_2013-04-05 Linux64]
 +
** Windows 7 64 [http://download.slicer.org/bitstream/41910 Slicer_nightly-build_2013-04-05 Win64]
 +
** Windows 7 32 [http://download.slicer.org/bitstream/41889 Slicer_nightly-build_2013-04-05 Win32]
 
* '''Datasets''':  
 
* '''Datasets''':  
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Please download the following datasets.
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**[[media:3DVisualizationData.zip‎|Dataset 1: 3D Visualization Data]]
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**[[media:3DVisualizationData.zip‎|Dataset #1: 3D Visualization]]
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**[[media:WhiteMatterExplorationData.zip|Dataset 2: White Matter Exploration Data]]
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**[http://www.slicer.org/slicerWiki/index.php/File:WhiteMatterExplorationData.zip Dataset #2: White Matter Exploration dataset].
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**[[media:Dcmtk-db.zip| Dataset 3: DCMTK Database Folder Data]]
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**[[media:Dcmtk-db.zip| Dataset #3: DCMTK Database Folder]]
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**[[media:DCE_series.zip| Dataset 4: Prostate Data]]
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** [http://wiki.slicer.org/slicerWiki/index.php/Modules:OpenIGTLinkIF-3.6-Simulators Dataset 5: Simulator: OpenIGTLink Simulator]
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* '''Simulator''':
 
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Please download the simulator for the OpenIGTLink Tutorial
 
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**[http://wiki.slicer.org/slicerWiki/index.php/Modules:OpenIGTLinkIF-3.6-Simulators OpenIGTLink Simulators]
 
  
 
=参加者リスト=
 
=参加者リスト=
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* Jonas Aditya Pramudita, 新潟大学 工学部, Windows 7(64bit), 4GB
 
* Jonas Aditya Pramudita, 新潟大学 工学部, Windows 7(64bit), 4GB
 
* 星 雄陽, 早稲田大学 理工学術院, Windows 7(64bit), 8GB
 
* 星 雄陽, 早稲田大学 理工学術院, Windows 7(64bit), 8GB
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* 今村 力也, AZE, Ltd.
 
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Latest revision as of 03:54, 9 April 2013

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English Page

Objective:

The purpose of this workshop is to introduce Slicer 4 in Japanese image processing community and invited them to participate in Open Source software effort within medical image processing community. The learning objective of the workshop is to 1) understand the basic usage of 3D Slicer version 4, (2) perform image segmentation in Slicer 4, (3) learn how to use Slicer in image-guided therapies. The targetted audience is scientists and graduate students in medical image processing and image guided surgery.


Dates and Location:

  • Date: Tuesday 4/9/2013
  • Location: AZE, Tokyo Office

日本語ページ

目的

このコースは、オープンソースソフトウェア3D Slicerのバージョン4について国内で始めて行うチュートリアルです。新しいSlicerを活用して画像誘導手術シミュレーション、ナビゲーション、医用画像処理について体験講義を行うことを目的としています。通常の講義とは異なり、実際に自分のパソコンにソフトウェアをダウンロードして、臨床で用いられている画像データを使いながら、直接「手」で先端研究を感じてもらうことがコースの目的です。コースで使用するソフトウェアは無償でプログラムソースコードが公開されており、コース終了後はこのソフトウェアを中心に研究を展開することができます。この展開方法についてもコース内で触れます。ハンズオンセミナーの質をあげるため、受講者の人数を制限し受講者に対する講師陣の人数を限りなく多くするようにとりはからっています。

主催

協賛

日時

４月９日（火曜日）午前９時より午後４時３０分

場所

  • 株式会社AZE 東京本社　トレーニングルーム
    • 〒100-0005　東京都千代田区丸の内1丁目8番1号
    • 丸の内トラストタワーN館13F　
    • Tel: 03-3212-7721


講師

  • AZE R&D Boston Karl Diedrich, PhD
  • ハーバード大学医学部　准教授　波多伸彦, PhD
  • ハーバード大学医学部　教授　Ron Kikinis, MD
  • AZE R&D Boston Nicholas, PhD
  • ハーバード大学医学部 助教　Sonia Pujol, PhD

講義シラバス

２月中に内容を更新していきます。脳画像処理に留まらない一般的な画像処理についてのチュートリアルになる予定です。

午前の部

昼食

  • 11:30-12:30 昼食（会場付近にて参加者各人で外食）

午後の部

参加申込

  • 申し訳ありませんが、定員に達したため登録を閉め切りました。９月のMICCAI（名古屋）開催時に時期を合わせて次回のワークションプを開催する予定です。

Preparation for the Workshop

The workshop combines oral presentations and instructor-led hands-on sessions with the participants working on their own laptop computers. A technical training staff will be providing one-to-one assistance as needed. All participants are required to come with their own computer and install the 3D Slicer software and data. Windows, Linux or MacOS Lion are supported. A minimum of 4GB of RAM (8 or more are recommended)and a dedicated graphic accelerator with 1GB of on board graphic memory are required.

Please download the following software and datasets.

参加者リスト

  • 岡本 孝英, 帝京大学医学部附属病院, MacOSX 10.8, 8GB
  • 前野 哲輝, 国立遺伝学研究所, MacOSX 10.8, 8GB
  • 長谷川 雄史, NLTテクノロジー, Windows 7 (32-bit), 4GB
  • 中村 亮一, 千葉大学大学院工学研究科, Windows 7 (64-bit), 8GB
  • 杉野 貴明, 千葉大学大学院工学研究科, Windows 7 (64-bit), 8GB
  • 鳥井 亮汰, 千葉大学工学部メディカルシステム工学科, Windows 7 (32-bit), 2GB
  • Pham Duc Tai, 千葉大学工学部メディカルシステム工学科, WIndows 8, 8GB
  • 小杉 崇文, (株)アールテック, Windows 7 (64-bit), 6GB
  • 石井 昭良,（有システムアイデザイン研究所, MacOSX, 4GB
  • 倉田 智宏, タカノ株式会社, Windows 7 (32-bit), 4GB
  • 趙 明浩, 千葉県がんセンター消化器外科, Windows 7, 1.6GB
  • エズム トルスン, 千葉大学　工学研究科, Windows Vista, 2GB
  • 浅井 義之, 沖縄科学技術大学院大学オープンバイオロジーユニット, MacOSX 10.8, 8GB
  • 李俐, インタセクト・コミュニケーションズ株式会社, MacOSX 10.4, 4GB
  • 赤井 喜徳, 三田市民病院 診療技術部 放射線科, Windows 7, 4GB
  • 上野彩子, 東北大学大学院情報科学研究科, Windows 7 (64-bit), 24 GB
  • 片山 統裕, 東北大学大学院情報科学研究科, Windows 7, 8GB
  • 加藤綾子, 埼玉医科大学, Windows 7 (64-bit), 8GB
  • 酒向 司, キヤノン（株）, Windows 7, 8GB
  • 松木 直紀, キヤノン（株）, MacOSX 10.7, 4GB
  • 土本 智一, キヤノン（株）, Windows 7 (64-bit), 4GB
  • 矢尾哲彦, キヤノン（株）, Linux (64-bit), 8GB
  • 水澤 悟, キヤノン（株）, MacOSX 10.6, 2GB
  • 嶋村 謙太, コニカミノルタテクノロジーセンター（株）, Windows 7 (64-bit), 8GB
  • 溝部 秀謙, キヤノン（株）, Windows 7, 8GB
  • 小森 元博，新潟大学 自然科学研究科, Windows 7(64bit), 8GB
  • 進藤 直哉，新潟大学 自然科学研究科, Windows 7(64bit), 8GB
  • 松田 幸久, 金沢医科大学精神神経科学, MacOSX 10.8.3, 16GB
  • Jonas Aditya Pramudita, 新潟大学 工学部, Windows 7(64bit), 4GB
  • 星 雄陽, 早稲田大学 理工学術院, Windows 7(64bit), 8GB
  • 今村 力也, AZE, Ltd.

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