Slicer WS Morioka 2015
Contents
Image-Guided Therapy Research using Open Source Free Software 3D Slicer
Deformable registration in Imagge-guided therapy
The objective of this workshop is to learn to use 3D Slicer in medical research. Participants will bring their own laptop, install 3D Slicer, and practice diffusion tensor imaging (DTI) tractography, and image segmentation using real clinical data. They will first be taught how to use the Grow Cut Segmentation and Label Statistics Slicer modules using ordinary clinical ultrasound images. Attendees will be given a lecture by an expert in 3D Slicer using a Japanese language version of the tutorial slides. The workshop will be followed by a demonstration by an IGT researcher from Brigham and Women's Hospital modifying 3D Slicer to tailor its use to clinical applications. Another demonstration by Dr. Kazunori Baba, a clinical expert on ultrasound scanning from Saitama Medical Center, will follow. A plenary talk by Dr. Ron Kikinis is scheduled midway through the workshop
Agenda
- August 6, 20135
- Target audience: Physicians, Fellows, and Residents
Japanese Version
画像誘導手術におけるオープンソース変形統合ソフトウェア
このワークショップはオープンソースソフトウェア3D Slicer を用いて画像誘導手術向けシュミュレーション, ナビゲーション勿論のこと本会の特徴は従来の医用画像CT, MRIに加え超音波画像処理について臨床医（脳外科, 外科, 放射線科, 泌尿器科, 小児科, 産婦人科等）・工学者・大学院生の現場に見合った基礎を含めた実践講義を目的とした事です. 特に, この度は臨床産科超音波画像を用いGrow Cut Segmentation と Label Statistics のデモンストレーションを行います. 特別講演は埼玉医療センター教授 馬場一憲先生 とBrigham and Women's Hospital and Harvard Medical School 教授 Ron Kikinis先生のお二方が3D超音波画像と3D Sliceについてレクチャーして下さいます. 馬場教授は3D超音波の開発, そしてRon 教授は3D Slicerの臨床用開発に携わり両教授は各分野でのエキスパートです. ワークショップは各々のパソコンにフトウェアをダンロードし, 皆さんが臨床で用いる画像データーを自身で3D Slicerにローデイングし先端画像処理を実践できます. ワークショップで用いるソフトウェアは無償でプログラムソースコードが公開されており, ソフトウェア終了後は皆さんのアイデアにより画像処理やシュミュレーション技術を探求する事が可能です. 同時に画層処理・技術探求について興味を抱いた方は講師からアドバイスを得る事が出来る機会でもあります. このワークショップは Brigham and Women's Hospital のIGT 研究所 の監修のもと開催されます.
日程
- ８月６日
- 午前9時から午前9時10分 主催者挨拶 (杉山徹/波多伸彦)、パソコン準備
- 午前9時10分から午前10時20分 Data Loading and 3D Visualization (Sonia Pujol/波多伸彦)
- 午前10時20分から午前11時20分 Diffusion Tensor Imaging Tutorial (Sonia Pujol/波多伸彦)
- 午前11時20分から午後12時20分 特別講演3D Slicer, 臨床への応用 (Ron Kikinis/ 杉山 徹)
- 午後12時20分から午後1時0分 昼食及び協賛会社商品紹介
- 午後1時0分から午後2時0分 Neurosurgical Planning Tutorial (Sonia Pujol/波多伸彦)
- 午後2:00分から午後2:30分 Lecture The DTI tractography Challenge for Neurosurgical Planning (Sonia Pujol)
- 午後2時30分から午後2時45分 質疑応答 Coffee break
- 午後2時45分から午後3時15分 胎児頭蓋内超音波画像のSegmentationの実際(小山理恵 )
- 午後3時15分から午後3時20分 3D Slicerを用いた先端医用画像研究(Sonia Pujol)
- 午後3時20分から午後3時30分 閉会の辞 (本田達也)
参加要領
参加者は 講義当日までに各自のノートブックパソコンに下記に記したSlicerをダウンロードしてインストールしてきください. インストールは通常の商用ソフトと同様自動です. 主として医師、研修医、技師、理工学大学院生を対象としてカリキュラムは組まれています. 当日は有線ケーブルよるネットワークへの接続を行います（無線,有線LAN対応可). 可能な限り参加者ご自身で予め3D Slicerソフトウェア，サンプルデータ, チュートリアル資料をダウンロードしてご持参下さい. お時間の無い方は会場にてインストールのお手伝いを致します. その場合は恐れ入りますが３０分前までには会場へお越し下さい.
- 3D Slicerソフトウェア
- データーセット
- チュートリアル
- Slicer日本語チュートリアル
以下のチュートリアルは、立命館大学情報理工学部 陳研究室の木西基（もとい）さんの協力を得て、翻訳作成されました。木西さんは立命館大学短期研修プログラムでSurgical Planning Laboratoryに滞在され、このスライドの作成に協力くださいました。
- 3D Slicerの基礎(PPT)日本語
- データの読み込みと表示(PPT)日本語
- 自動画像統合(PPT)日本語
場所
- 岩手医科大学 循環器医療センター10階（岩手銀行と歯学部との間）
岩手県盛岡市内丸19-1, 020-8505.
岩手医科大学付属病院内, 周辺に有料駐車場が多数あります. しかし時間帶により混雑が予想されますので公共交通機関もしくは盛岡駅からの徒歩をお勧めします.
岩手医科大学内丸キャンパス
循環器医療センター
交通機関
- 新幹線, 航空路による盛岡までのアクセス
- 盛岡駅から岩手医科大学までタクシーで5~10分、バス(バスセンター行き岩手銀行前で降車)10分、徒歩15~20分.
宿泊
講師
- 波多伸彦 Brigham and Women’s Hospital and Harvard Medical School
主催
協賛
過去の国際セミナー
- Ron Kikinis教授の講演 Slicer-Hands-On Meeting 東京女子医科大学 2010.
- 波多伸彦准教授の講演 Slicer-Hands-On Meeting 東京女子医科大学 2010.
参加登録
- 参加費無料
- 参加希望者はryoshimitsu.kitaro@twmu.ac.jpまで名前, 所属, 使用パソコンのOSをお送りください.
- 定員：20名程度
参加者リスト
謝辞
会場ネットワーク設定は有限会社ヤマダプランニング様. 皆様に深く感謝致します.
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