2016 Winter Project Week/Projects/TrackedUltrasoundStandardization

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  Projects List

Key Investigators

• Andras Lasso, Tamas Ungi (PerkLab, Queen's University)
• Christian Askeland, Ingerid Reinertsen, Ole Vegard Solberg (CustusX, IGT research, SINTEF)
• Simon Drouin (Mcgill University, Montreal, Canada)
• Junichi Tokuda (BWH)
• Steve Pieper (Isomics)
• Adam Rankin (VASST Laboratory, Western University, Canada)
• Thomas Kirchner, Janek Gröhl (MITK, DKFZ, Heidelberg, Germany)

Project Description

Objective	Approach and Plan	Progress and Next Steps
Establish a common software platform for tracked ultrasound and image-guided interventions by converging existing IGT toolkits: 3D Slicer, SlicerIGT extension Plus toolkit CustusX IBIS Echelon MITK-IGT	Pre-Project Week online meetings and emails Notes below Design document from SINTEF Coordination with the CommonTK effort Survey of current implementations and use cases Development of long-term development practices to encourage collaboration	Minutes of preparation meetings Live meeting minutes

OpenIGTLink Revisions

Tracked ultrasound OpenIGTLink client

• Move out part of OpenIGTLinkIF
• Only use OpenIGTLink and VTK

Command

• COMMAND
  • Command ID (uint32) 4
  • Command name (uint8[32]) 32
  • Content encoding (uint16) 2
  • Content (uint8*) - rest of the body

• RTS_COMMAND: (return to sender command)
  • Command ID (uint32) 4
  • Command status (uint8[32]) 32
  • Content encoding (uint16) 2
  • Content (uint8*) - rest of the body

Meta Data

Header V1

Bytes
0   2                       14                                      34              42              50              58
+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+
| V | TYPE                  | DEVICE_NAME                           | TIME_STAMP    | BODY_SIZE     | CRC64         |
+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+

Header V2

Bytes
0   2                       14                                      34              42              50              58                60              64        68          72
+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+---------------+-+-+-----------+-+-+-+---+-+-+-+-----+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-
| V | TYPE                  | DEVICE_NAME                           | TIME_STAMP    | BODY_SIZE     | CRC64         | EXT_HEADER_SIZE | METADATA_SIZE | MSG_ID  | RESERVED  | CONTENT…  | METADATA… |
+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+---------------+-+-+-----------+-+-+-+---+-+-+-+-----+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-

EXT_HEADER: v1 header (58 bytes) + new header (EXT_HEADER_SIZE bytes)

CONTENT (=v1 body): BODY_SIZE - EXT_HEADER_SIZE - METADATA_SIZE

METADATA:

Bytes
2                    4                        6                      10                  12                        14  INDEX_COUNT * 8
+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+
|INDEX_COUNT (uint16) | KEY_SIZE (uint16) | VALUE_ENCODING (uint16) | VALUE_SIZE (uint32) | KEY_SIZE (uint16) | VALUE_ENCODING (uint16) | … | KEY | VALUE | KEY | VALUE | … |
+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+

VALUE_ENCODING: as specified at http://www.iana.org/assignments/character-sets/character-sets.xhtml

BODY: Contains extended header data, message content, and metadata.

Presentations

• Adam Rankin, Robarts Research Institute
• Andras Lasso, PerkLab, Queen's University
• Thomas Kirchner, CAI group, German Cancer Research Center